Organic chemistry有機化學OC

統一有機化學和無機化學的理論[]

基本有機化學反應[]

大多數的有機化學反應可以看做電子多(因此常常帶負電)的物質(親核劑)和電子少(因此常常帶正電)的物質(親電劑)間的反應，也就是負電和正電相吸引的反應。(也就是polar reaction 極性反應)(這只是簡單而言，事實上誰和誰反應要用分子軌域理論解釋)

各種有機物以揮發油為例

有機化學物種以及各自進行極性反應(polar reaction)類型:[]

有機化學反應分成三大類，最簡單的就是極性反應(polar reaction)，就負電(nucleophile親核劑Nu”(核帶正電))和正電(electrophile親電劑E+(因為本身帶正電))的反應。

譬如高溫烹調食品(譬如烤或是炸的食品)會產生多環芳香烃類，是一種前致癌物，人體為了將他排除而把它代謝成環氧烷類(高陰電性EN的氧上的碳會缺電子而帶正電，變成親電劑)，因此和帶負電的DNA(親核劑)反應造成DNA突變:

polar reaction(極性反應)=electrophile+nucleophile
electrophilic	Addition(加成反應)
	Substitution(取代反應)
Nucleophilic	Addition
	Substitution
Rearrangement重排反應
radical reaction自由基反應
radical reaction	Addition
	Substitution
Rearrangement重排反應
pericyclic reaction(分子軌域對稱性允許反應)(圍環反應)
pericyclic reaction( a kind of rearrangement? )	electrocyclic reaction電環反應
	Cycloaddition環加成反應
	sigmatropic reaction西格瑪鍵變動反應

*機轉的解釋有:

**electronic factor(電子因素)

**steric factor(立體因素)

合成反應在生物學常常為脫水(dehydration，縮和聚合(condensation polymerization))；分解反應在生物學常常是水解(hydrolysis)

有些反應可以使E+和Nu”互相轉換(unpolung (極性逆轉)) Ex. 1,3-dithiane synthesis

把N變成E+的方法:Mannich reaction；N當Nu”的方法:Stork reaction

Alkane烷(ㄨㄢˊ)

CnH2n+2

Electrophile

沒

Nucleophile

沒

alkyl halide鹵烷

R-X

Electrophile

滿強的，僅次於acid halide/acid anhydride

Chlorofluorocarbons(氟氯碳化物CFC(s))

Electrophile但是課本只教他破壞臭氧(當酶)的自由基反應

organometallic cpd有機金屬OM

R-Li

R-Mg-X

nucleophile/base

依不同的金屬分別是強或是弱

Alkene烯

多取代比較穩定

Electrophile

遇到強Nu”才會(像是R-Li+)

Nucleophile

有，所以有electrophilic reaction之addition(弱)

Alkyne炔

多取代比較穩定

Electrophile

沒

Nucleophile

有，所以有electrophilic reaction之addition

Enol烯醇

Nucleophile

有，所以有electrophilic reaction之addition(自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應)

Enamine烯胺

Nucleophile

有，所以有electrophilic reaction之addition(自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應)

當nucleophile處稱作Stork (enamine) reaction

α,β-unsaturated aldehyde

Electrophile

共軛雙鍵延伸了carbonyl carbon這個E+，因此使本為Nu”的雙鍵變成E+(自己先共振而產生分子內E+再吸引分子外Nu”參與反應)

α,β-unsaturated ketones

Electrophile

共軛雙鍵延伸了carbonyl carbon這個E+，因此使本為Nu”的雙鍵變成E+(自己先共振而產生分子內E+再吸引分子外Nu”參與反應)

Benzyne苯炔

Electrophile

Benzyne活性大，會和Nu”反應

Nucleophile

有，所以有electrophilic reaction之addition

aromatic cpd

Ar-H

Nucleophile

比alkene弱，但

Activated Ar和alkene可比 Ex. Phenol(自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應)

Benzene兩旁接benzene(phenanthrene (菲)和anthracene(蒽))可在alkene的反應條件和其行相同反應(kinetic control)。亦可以在electrophilic aryl substitution的反應條件下行該反應。(thermodynamic control)

五員芳香雜環

Nucleophile

> >

其他六員芳香雜環

electrophile

pyridine

Amine胺

R-NH2

Acid

Base

Nucleophile

其他

*高能狀態下的amine(質譜儀) *α-cleavage reaction

*Histone(組蛋白:含有高含量帶正電的lysine(N端，可以做methylation修飾)和arginine(非histidine?)，所以可以和帶負電的DNA結合

Alc醇

ROH

Pinacol: a 1,2-diol

電子多者重排快速，H為例外(太輕):

H>3級>2級=phenyl=allyl>1級>methyl

Acid

Nucleophile

*通常是使之變成好的離去基以後變成好的electrophile以進行nuceophilic reaction(HCl可，但是要加ZnCl2)

*SB去H+之後成Nu”

*接受器本身是酶(ligand-regulated transmembrane enzyme)的接受器: 有2個 domain, which intracellular domain may be a protein tyrosine kinase、serine kinase、 threonine kinase or guanylyl cyclase

*PKA常常為serine/threonine kinase(cytoplasmic pt. kinase)

其他

*高能狀態下的alc(質譜儀)

**α-cleavage reaction

**Elimination脫去H2O(M-18)

**因為以上兩種反應，所以M+不明顯。以上兩種反應互為競爭，一種多則另外一種少

* Pinacol rearrangement:認反應中間物，有一類的反應中間物會出現所謂Pinacol重排的機轉。

Phenol酚

Ar-OH

Acid

Nucleophile

*SB去H+之後成Nu”

*比benzene加methoxy強(自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應)

Ether醚

ROR’

Nucleophile

通常是使之變成好的離去基以後變成好的electrophile以進行nuceophilic reaction(HCl不可)

其他

*高能狀態下的ether(質譜儀)

**α-cleavage reaction

**因為以上反應，所以M+不明顯

硫醇thiol

Mercaptan

RSH

-(O)→R-S-S-R’ disulfide

二硫化物(有雙硫鍵，為強化學鍵)，更成痰的化學鍵，用acetylcycteine打斷乙醯化半胱胺酸

Acid

因為軟硬酸鹼理論，所以酸性強於ROH

Nucleophile

Ex.天然抗氧化劑-三胜肽Glutathione穀胱甘肽

可以把被氧化成RSSR的地方還原為RSH

感冒時，體內的S以RSSR(氧化態)存在的量會變多。

Carbonyl cpd.

羰基化合物

Enol ether=

C=O

人名反應之Vilsmeier-Haak reaction

aromatic cpd+

DMF+POCl3

aromatic aldehyde

因為共振，所以acid der.喜以O提供電子當作Nu”，其O具有鹼性。就連含氮化合物amide的鹼性也是來自O，但是很弱。

Carbonyl上是否為goob LVG	Carbonyl cpd.	所進行的反應	α,β-unsaturated Carbonyl cpd. 所進行的反應(1,2-add and 1,4-add(廣義的Michael add))	P.S.
Good	acid halide	Nucleophilic substitution	1,2-add→substitution
Good	acid anhydride	Nucleophilic substitution	1,2-add→substitution
Bad	Aldehyde	Nucleophilic addition: Reversibility由nucleophile的鹼性強弱(熱力學)決定，離去時諸如H2O, ROH, HCl, HBr, H2SO4...等的Nu”可逆。	1,2-add or 1,4-add
Bad	Ketone		1,2-add or 1,4-add
Good	Ester	Nucleophilic substitution	1,2-add→1,4-add
Good(和醛酮比)	Amide	Nucleophilic substitution	1,2-add→1,4-add	Amide 的氮上尚有l.p. 可參與反應(imide同理) acid halide雖有，但因為陰電性太強不參與反應
Good(和醛酮比)	Carboxylate	Nucleophilic substitution	1,2-add→1,4-add?

Carbonyl上是否為goob LVG	Carbonyl cpd.	α,β-unsaturated Carbonyl cpd. 所進行的反應	P.S.
Good	acid halide	1,2-add→substitution
Good	acid anhydride	1,2-add→substitution
Bad	Aldehyde	1,2-add or 1,4-add
Bad	Ketone	1,2-add or 1,4-add
Good	Ester	1,2-add→1,4-add
Good(和醛酮比)	Amide	1,2-add→1,4-add	Amide 的氮上尚有l.p. 可參與反應(imide同理) acid halide雖有，但因為陰電性太強不參與反應
Good(和醛酮比)	Carboxylate	1,2-add→1,4-add?

Carbonyl cpd.活性大小		Nu”活性大小	α,β-unsaturated Carbonyl cpd. 所進行的反應產物(受立障(現實)修正)	1,2 or 1,4
Aldehyde	強	強	Kinetic	1,2-add
Aldehyde	弱	弱	Kinetic	1,2-add
ketone	強	強	Kinetic	1,2-add
ketone	弱	弱	Thermodynamic	1,4-add Ex. Carbonyl condensation

這是歸納法，有機的凡人使用來背誦；有機的天才不需要歸納，直接看到一個化合物就直接探討出會產生什麼反應。以amide為例；有反應是amide的N上的l.p.參與反應，沒有想到是因為用acid halide和acid anhydride歸納類推會進行親核性取代反應。有機的天才不會只受到經驗影響，看到每一種carbonyl cpd.都會考慮每一個可能當Nu”和E+的地方，也就是在探討新的問題前，每一個carbonyl cpd.在他眼裡看起來都是:

一樣的。

2種涉及α-H的反應

			regiochemistry
Acidic condition	Thermodynamic		Thermodynamic site
Basic condition	WB+WA(一般aldehyde and ketone)	Thermodynamic	Thermodynamic site
	WB(OH-, OR-)+ SA(imide or malonic ester or acetoacetate)	kinetic	Kinetic site
	SB(LDA)+ WA(一般aldehyde and ketone)

但是事實上鹼的量、溶劑…等也會造成影響。

*高能狀態下的carbonyl cpd(質譜儀)

**α-cleavage reaction

**McLafferty rearrangement

acid halide

Electrophile

可以說是所有的有機物分類中最強的 electrophile

Nucleophile

在酸性條件下因為可以進行tautomerism，所以變成有nuceophilicity的enol而進行α-bromination(Hell–Volhard–Zelinsky halogenation of carboxylic acid)(自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應)

acid anhydride酸酐

Electrophile

僅次於acid halide

Nucleophile

自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應perkin condensation

aldehyde

自己先共振而產生electrophile再參與反應(ketone也同理，所以和ketone比起來，因為ketone有兩個推電子的烷基可以穩定共振產生的碳陽離子，所以使得這個共振產生的結構共振混成體的貢獻度變高，因此ketone極性比aldehyde高且反應性也比較高，但因aldehyde立障比較小所以活性還是比較大)

Electrophile

*carbonyl carbon僅次於acid anhydride

*αH is acidic

Nucleophile

*酸性或是鹼性中αC若有αH則有nucleophilicity，進行α-substitution或是carbonyl condensation(Ex. Aldol condensation)

**酸性中形成enol

**鹼性中形成enolate

*少見用carbonyl oxgen打別人

自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應*propanedithiol可以使carbonyl carbon變成nuceophile

Ketone

Electrophile

*carbonyl carbon僅次於aldehyde

*αH is acidic

Nucleophile

*酸性或是鹼性中αC若有αH則有nucleophilicity，進行α-substitution或是carbonyl condensation(Ex. Aldol condensation)

**酸性中形成enol

**鹼性中形成enolate

*少見用carbonyl oxgen打別人

自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應

Imine(亞胺)(Schiff base(from 1級amine))

and analog

可以氫化(還原)成amine

有一個AA是明明是cyclic secoundary amine，但生化常常稱之iminoacid

Electrophile

imine↹enamine烯胺( from 2級amine)

Iminium ion亞銨離子( from 沒αH的2級amine)

sufoxide

亞碸/硫氧化物

Nucleophile

自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應有S的Rxn中S常常帶正電而其上原子帶負電打人?

swern oxidation

S帶正電常as LVG?

碸（音同「風」，英語：sulfone）是含有R-(O=)S(=O)-R'結構的有機化合物統稱。碸官能基結構也稱磺醯基。

治療麻風病的二氨二苯碸（達普頌）和環丁碸等。

達普頌（Dapsone）又稱氨苯碸、二胺苯碸或DDS（diaminodiphenyl sulfone）

環丁碸又名四氫噻吩-1，1-二氧化物，為無色透明液體，是一種優良的非質子極性溶劑，可與水、丙酮、甲苯等互溶。也是石油化工上芳烴抽提工藝中的理想試劑。

Other S cpd.

Sulfur ylide

(CH3)2S+=CH2

Electrophile

有，acidic

Nucleophile

有

有S的Rxn中S常常帶正電而其上原子帶負電打人?

Phosphorous ylide

Wikipedia user V8rik

Nucleophile

Wittig Rxn

我流alkene synthesis in basic condition via polar mech. of Wittig by aldehyde/ketone

*Regiochemistry

*Stereochemistry-stereospecificity:

Stabilized ylide→E form

un Stabilized ylide→Z form

Ester酯

Electrophile

次於aldehyde/ketone

Nucleophile

自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應

Amide(醯胺)

和hydroxyimine(羥基亞胺)互為tautomerism

Electrophile

次於ester,

Amide上的H is acidic(Hα)

Nucleophile

*在鹼中amide N上的H失去後成Nu”

*少見用carbonyl oxgen打別人

自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應

人名反應之Vilsmeier-Haak reaction

aromatic cpd+

DMF+POCl3

aromatic aldehyde

共振，所以醯胺鍵(胜肽鍵)比起其他的carboxylic acid der.的鍵強，所以不容易斷(不容易變成離去基)，活性也較小。

base

Amide 因為共振，所以O有鹼性而不是N，其他acid der.同理。只不過鹼性很弱。並且O和N都是混成。

Imide(亞醯胺)(醯亞胺)

Imide_functional_group

Nucleophile

*NBS和CCl4的Sy差(不似Br2和alkene都可以溶於CCl4中)，雖然能提供Br2，但濃度低，能避免親電性加成反應競爭，所以自由基反應愛用NBS。

*N上的R=H時，相當於α-H，可以用鹼去H成為鹼N-，以Sn2機轉和E+反應，只能用來製備一級胺-蓋布瑞爾伯胺合成反應 (Gabriel synthesis)

Carboxylate羧ㄗㄨㄟ酸根

Electrophile

次於amide

Nucleophile

因為carboxylic acid有酸性，所以carboylate是一種不好的nucleophile

自己(分子內Nu”&E+)先共振而產生nucleophile再參與反應

Chromate(鉻酸根)

Electrophile

無水條件下氧化一級醇為醛

有水條件下氧化一級醇為酸

氧化2級醇為酮?

分辨:

Permanganate(過錳酸根)MechanismOxidation.svg

Dihydroxylation_with_Osmium tetroxide(四氧化鋨)

~carbonyl cpd.

O=C=O二氧化碳

Electrophile

C≡O一氧化碳

Electrophile

一個碳上接兩個高陰電性原子的化合物

Electrophile

如果有Hα則有酸性

Aldehyde/ketone/hydrazine肼

imine/iminium ion

茚三酮Ninhydrin test和alpha-amino acid反應得紫色

nucleophile

1,3-dithiane of Corey-Seebach Rxn

一個碳上接三個高陰電性原子的化合物

Electrophile

如果有Hα則有酸性

Orthoester

Wikipedia public domain

Johnson–Claisen rearrangement

The Johnson–Claisen rearrangement is the reaction of an allylic alcohol with an orthoester containing a deprotonatable alpha carbon(E1CB?) (e.g. triethyl orthoacetate) to give an γ,δ-unsaturated ester.

Wikipedia user ~K

西100-34

有Hα的化合物

共振拉電子基比較強。

活化C-terminal(成anhydride,因DCC為脫水劑)

是一種Imide

N, N'-二環己基碳二亞胺

dicyclohexylcarbodiimide

DCC

Electrophile

Phenyl isothiocyanate (PITC)

Electrophile

Edman degradation(peptide sequencing):

Sugar糖

看前面章節圖

Electrophile

Aldose醛糖的-COH和ketose酮糖的CO分別可以當作E+

Nucleophile

-OH可以當作Nu”

胺基酸AA(amino acid)

酵素活性調節的共價修飾:

1. phosphorylation: Ser, Thr, Tyr

2. glycocylation: Ser, The, Asn

3. adenylation(+AMP): Tyr

4. acetylation: Lys

5. ubiquitin: Lys

6. ADP-ribosylation: Arg, Cys

7. Methylation: Glu

表基因遺傳學的調節:

8. acetylation: Lys

9. ubiquitin: Lys

10. phosphorylation: Ser

11. Methylation: Lys, Arg

Electrophile

-COOH可以當作E+ or 提供H+和自己的-NH2中和

Nucleophile

-NH2可以當作Nu”or 當鹼和自己的-COOH中和

Edman degradation(peptide sequencing):

Wikipedia Author David E. Volk at Citizendium

依R而可能具有酸、鹼或是還原劑…等性質

生化中20種必須氨基酸是合成蛋白質所用的氨基酸。蛋白質中常見的胺基酸有22種。

Peptide胜肽(<100個AA or M<5000)

如果沒有指明，寫在最左邊的AA是N-terminal(因為translation轉譯由N端開始)

短肽由串聯質譜tendem MS定序

Ex.天然抗氧化劑-三胜肽Glutathione穀胱甘肽

可以把被氧化成RSSR的地方還原為RSH

Protein蛋白質pt.(>100個AA or M>5000)

如果沒有指明，寫在最左邊的AA是N-terminal

最小的蛋白質是胰島素(insulin)

*primary structure of pt.蛋白質的一級結構-aminoacid sequence胺基酸序列. 共價鍵 Ex. Peptide bond, Disulfide bond(雖然主要的結構為肽鍵，但是形成雙硫鍵的位置要指出來)…etc.

*secondary structure of pt.蛋白質的二級結構-氫鍵(骨架上的C=O和N-H，非AA的R上造成)

*Tertiary structure of pt. 蛋白質的三級結構-各種作用力，包含:

氫鍵(AA的R上，非骨架上的C=O和N-H造成)

離子鍵

疏水作用力

凡德瓦力

雙硫鍵

* Quatinary structure of pt. 蛋白質的四級結構-大於或等於兩個胜肽或是蛋白質藉由各種作用力合成一個單位

primary structure of pt. 蛋白質的一級結構 aminoacid sequence	共價鍵	Ex. Peptide bond胜肽鍵( amide bond醯胺鍵), Disulfide bond(雖然主要的結構為肽鍵，但是形成雙硫鍵的位置要指出來)…etc.
secondary structure of pt. 蛋白質的二級結構	氫鍵(骨架上的C=O和N-H，非AA的R上造成)
Tertiary structure of pt. 蛋白質的三級結構	各種作用力，包含: 氫鍵(AA的R上，非骨架上的C=O和N-H造成) 離子鍵疏水作用力凡德瓦力雙硫鍵
Quatinary structure of pt. 蛋白質的四級結構	大於或等於兩個胜肽或是蛋白質藉由各種作用力合成一個單位	氫鍵(AA的R上，非骨架上的C=O和N-H造成) 離子鍵疏水作用力凡德瓦力雙硫鍵

cytosolic pt.	By free ribosome
membrane pt. pt.要送到membrane要接上sugar才送的到	peripheral pt. By free ribosome	peripheral membrane pt.		借H-bonding或ionic bonding和phospholipid或integral pt.結合	High pH carbonate、 Urea、 Chelator chelate Ca++可以拿下之
	integral pt. (intrinsic pt.)主體蛋白 By bound ribosome 疏水區域由nonpolar AA呈α螺旋	transmembrane pt. ( amphipathic pt.兩性蛋白) Ex. G pt. (7-TM)	channel pt.通道蛋白		用變性劑、清潔劑或有機溶劑可以拿下之
			carrier pt.攜帶蛋白
			Pump幫浦
			Receptor接受器
		lipid anchored pt.	僅伸入膜的疏水性內部

nitrogenous base(含氮鹼基)N

氫鍵數:

A=T

G≡C

nucleoside核苷(配糖體(~oside))

=糖+非糖(此處為含氮鹼基)

Nucleophile

5’-OH可以當作Nu”去打磷酸而形成磷酸酯(核苷酸nucleotide)(類似羧酸的酯化反應)

nucleotide核苷酸

Electrophile

5’-OH所形成的磷酸酯可以當作E+被另外一個核苷酸nucleotide的3’-OH打而形成核酸nucleic acid(聚酯)(類似羧酸的酯化反應)

生物體內藉由含有高自由能(可以做功)的分子(常常是磷酸化合物 Ex. ATP)提供能量驅動吸能反應(endergonic reaction)-energy coupling strategy(能量偶合策略)

Adenosine triphosphate腺嘌ㄅㄧㄠ呤核苷三磷酸(即三磷酸腺苷)ATP: 生物化學標準條件水解產能7.3kcal /mole

細胞條件生成: 13kcal/mole

*肝糖合成耗UTP

*磷脂合成耗CTP

*蛋白質合成耗GTP+ATP

*microtubule assembly耗GTP(運動蛋白耗ATP)

*intermediate filament耗不知

*microfilament耗ATP

ATP=ADP+Pi+能(ΔG0=7.3kcal /mole

ΔG=13 kcal /mole(人體))

ADP=AMP+Pi+能

AMP=X

Nucleophile

nucleic acid核酸

核酸是酸，但是在人體中是呈現鹽的酸鹼中和狀態

Nucleophile:

去攻擊致癌物而烷化自己

RNA核醣核酸

2’-DNA去氧核醣核酸(差在C2的O)

Intercalating agent常常也是topoisomerase II inhibitor

Carboxylate的保護基.

oxalyl chloride

ClCOCOCl

Electrophile

Oxazoline protection group of carboxylic acid

Wikipedia Author Project Osprey

If milder regents are required then SOCl2 may be replaced with oxalyl chloride.

Amine的保護基

Benzyl chloroformate

(benzoxy carbonyl chloride)

Electrophile

Wikipedia user Jü

Amine的保護基

Di-tert-butyl dicarbonate

(BOC)

Electrophile

Wikipedia public domain

用CF3COOH拿掉

Amine的保護基

9-flouronylmethyl chloroformate

Fluorenylmethyloxycarbonyl chloride (FMOC-Cl)

Electrophile

Wikipedia Author Felix Plasser

記立體構型有助於機轉的推斷:

烯類的取代基上包含雙鍵，六個原子共平面、E2形成具有烯類性質中間物

芳香環所有原子共平面

炔類取代基上第一個原子和三鍵上兩個原子共線。

肽平面(peptide plane)同理。

*理論上，反應是最強的Nu”和最強的E+，但是有時候不是最強的Nu”和最強的E+才可以得到最穩定的產物(熱力學產物)，那就不會最強的Nu”和最強的E+反應。如果有立障(影響動力學不影響熱力學)，就可能不是會得到熱力學產物的Nu”和E+反應(有時候是最強的Nu”和E+反應)，所以得到動力學產物。

*其實Nu”和E+的強弱常常指的是動力學(速率)，所以最強的Nu”和E+常常得動力學產物。

*Conclusion:以上，不管Nu”和E+強弱，熱力學條件得熱力產物；動力學條件得動力產物。

西101、104愛用沒看過的reagent，所以自己依鍵結原理推其為Nu”或是E+，並判別其和谁or哪個reagent的部位反應。

polymer種類	Monomer	鍵結種類	受何種酶水解	生物體的功用	最大貢獻者
Nucleic acid核酸	nucleoside triphosphate核苷三磷酸NTP(核苷酸)	phosphodiester bond磷酸雙酯鍵	phosphodiesterase磷酸雙酯酶PDE	儲存遺傳信息的載體、可能可以當作enzyme(酶，此種情形的nucleic acid就稱作ribozyme，像是ribosome中的rRNA	富蘭克林:開啟了生物化學、分子生物學的蓬勃發展。
polysaccharide	monosaccharide	glycosidic ether bond糖苷性醚鍵	glycosidase糖苷酶	[[]]	[[]]
protein	amino acid	amide bond醯胺鍵(=peptide bond胜肽鍵)	水解蛋白質的酶	enzyme酶，帶是常常需要先經過protein kinase蛋白激酶PK的活化(藉由phosphorylation(磷酸化)) PS.蛋白質的活化不一定是藉由protein kinase蛋白激酶的phosphorylation(磷酸化)，也有可能是藉由protein phosphatase蛋白質磷酸酯酶PP)去磷酸化(dephosphorylation)	基因組學之父桑格:發明了測序這個技術使得我們了解蛋白質具有結構，而且成為世界上第一個搞清楚其氨基酸排列順序的人。
lipid	不是polymer
[[]]

核酸的結構由華生和克立克發表而得諾貝爾獎，該論文只有一張紙和一個結構，是少數極度重要且內容超級少的論文。但是華生也因此受到批評，因為DNA結構的解析是因為華生拿到DNA的X光繞射圖給克立克發揮專長解出來的，但是該張圖其實是華生去女性科學家富蘭克林的實驗室牆上拿下來的，並且沒有經過富蘭克林的同意!只不過諾貝爾獎不頒給死人(有幾個例外)，因此富蘭克林於頒獎前死於卵巢癌，成了幕後最大的無名功臣。

酵素活性調節的共價修飾:

12. phosphorylation: Ser(S), Thr(T), Tyr

13. glycocylation: Ser, The, Asn

14. adenylation(+AMP): Tyr

15. acetylation: Lys

16. ubiquitin: Lys

17. ADP-ribosylation: Arg, Cys(C)

18. Methylation: Glu

表基因遺傳學的調節:

19. acetylation: Lys

20. ubiquitin: Lys

21. phosphorylation: Ser(S)